NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

2015-08-06から1日間の記事一覧

WGSデータの参照ゲノム配列へのマッピング (5): VCF fileの生成、アノテーション

2015-08-06Mapping結果の.bam fileから、SNPなどの多型を抽出して、VCF formatのfileを生成します。その後、Variant Effect Predictorを使ってSNPのアノテーションを行います。方法は以前紹介したこのエントリ(VCF fileの生成)や、このエントリ(Variant E…