NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

Python

blasrのインストール(cmakeを使用する)

ずいぶん久しぶりの更新(100日振り!)。でも忘れているわけではないのです・・・ Linux(ubuntu 16.04 LTS)にblasrをインストールした。いろいろ苦戦したので、方法の簡単なメモを残しておく。 blasrについては、以前も別のコンピュータにインストールしこ…

Phython3.6をインストールして切り替える

NGS解析のとき、使用するLinux (Ubuntu 16.04)でPyhton 3.6とPyhton 2.7を切り替えることがあるので、その方法についてのメモ。 pyenvを使用する。以下のサイトを参考にした。pyenvのインストールから、python3.6.0のインストールまではこちら。Python3.6.0…