NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

MiSeqデータのMHC領域へのマッピング(8):Rのインストール

2015-04-13

ここから、VCF formatのファイルを読んで、必要な情報(SNPサイト、SNPの位置・allele頻度、既知のSNPsとの関連など)の抽出を進めていきます。ここからの解析は、おもに統計パッケージのRを使用します。Rは以下のURLから、リンクをたどって入手、インストールして下さい。

www.okada.jp.org