2015-05-18ここでは、Variant Effect Predictorで得られたアノテーション情報を含むVCF formatファイルをダウンロードして、Rで読み込む方法を解説します。4. アノテーション情報を含むVCFファイルをダウンロードする解析結果の画面（前回の内容参照）で、設…

2015-05-18Variant Effect PredictorによるSNPのアノテーション結果について説明します。3. アノテーション結果を見る(1) Summary statistics 解析がうまく行くと、このような結果の画面を見ることができます。ここでの表と円グラフは、結果全体の要約になっ…

2015-05-18以下の記事も参考にしています。ショートリードの憂鬱 - 次世代シーケンサー: Ensembl - Variant Effect Predictor でSNPアノテーションここでは、データをリファレンスにマッピングすることで得られた多型（SNP）サイト（7回目の内容も参照）の情…