NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

2023-12-01から1ヶ月間の記事一覧

GenBankに公開されている魚類ゲノムのファイルを一括でダウンロードする

以下は、ほとんど自分用のメモ。 ncbi-genome-downloadなどを使って、NCBI Genomeの魚類ゲノムをまとめてダウンロードしたい場合、"vertebrate_other"を指定すると魚類以外の脊椎動物のゲノムも一緒にダウンロードされてしまうので、ちょっとした工夫が必要…