NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

2022-12-26から1日間の記事一覧

NanoporeロングリードからのアセンブラNECATとNextDenovo

最近使用しているNanopore (MinION)のロングリードからのアセンブラ2つ(230203現在:更新しながら公開しています)。 解析環境 Linux (Ubuntu 16.04 LTS) Intel® Xeon(R) CPU E5-2640 v4 @2.40 GHz x 40 (40 threads), 512 GB RAM アセンブラ NECAT github.…

2022-12-06の近況

12月になって、急に冬らしくなりました。最近は、講義の合間に停滞気味の研究を進めつつ、12/21-23の九州大学大学院での集中講義の準備に追われています。今年は本当に忙しい年のようです。。(2022-12-06)おまけ 年末の九大での集中講義は、雪が降ってびっ…