NGSデータ解析まとめ

サカナ研究者の手探りNGS解析(おもに進化生物学)

2025-04-01から1ヶ月間の記事一覧

PacBioのHiFiリードからミトゲノムを選択して再構成するMitoHiFi(使用メモ)

最近、PacBioのHiFiリードからミトコンドリアゲノムを選択して再構成するMitoHiFiを使用する機会があったので、その使用メモです。github.com はじめに ロングリードのゲノムアセンブリから、ミトコンドリアゲノム(ミトゲノム)のみを抽出して使用したい場…

2025-02-18の近況

早くも2月後半ですが、寒い日が続きますね。集中講義など大きな仕事が終わって少し落ち着きましたが、あいかわらずいろいろと仕事が続きます。(2025.2.18) 3月の福岡調査より(ヤリタナゴとアブラボテ)アユモドキ(鳥羽水族館にて)